Integrasi pembelajaran berbasis web telah menciptakan peluang baru untuk meningkatkan praktik pengajaran dan pembelajaran di berbagai lingkungan pendidikan, termasuk Pendidikan Agama Islam (PAI). Namun, bukti kualitatif yang menjelaskan bagaimana pembelajaran berbasis web mentransformasi praktik instruksional dan memengaruhi pengalaman belajar siswa dalam pendidikan agama masih terbatas. Penelitian ini mengeksplorasi penerapan pembelajaran berbasis web dalam PAI, dengan fokus pada kontribusinya terhadap keterlibatan siswa, otonomi belajar, dan pengalaman belajar yang inklusif. Pendekatan kualitatif deskriptif dalam paradigma interpretivis digunakan dalam penelitian ini. Data dikumpulkan di SMP Daarul Rahman Tempuling, Riau, Indonesia, melalui observasi kelas, wawancara semi-terstruktur, analisis dokumen, dan catatan lapangan yang melibatkan dua guru Pendidikan Agama Islam, satu kepala sekolah, dan sembilan siswa Kelas VII yang dipilih menggunakan teknik *purposive sampling*. Data dianalisis menggunakan metode analisis tematik enam tahap dari Braun dan Clarke. Temuan penelitian mengungkapkan tiga tema utama. Pertama, pembelajaran berbasis web mentransformasi praktik instruksional dengan mendorong pembelajaran yang lebih interaktif, fleksibel, dan berpusat pada siswa melalui platform digital seperti Google Classroom, Google Forms, dan YouTube. Kedua, meskipun konektivitas internet, literasi digital, dan keterbatasan infrastruktur tetap menjadi tantangan signifikan, para guru melakukan adaptasi strategi instruksional untuk mempertahankan kegiatan pembelajaran. Ketiga, pembelajaran berbasis web meningkatkan keterlibatan siswa dan otonomi belajar dengan mendorong partisipasi aktif, memperbaiki akses ke sumber belajar, dan memperluas pembelajaran melampaui instruksi di dalam kelas. Penelitian ini berkontribusi pada literatur yang terus berkembang mengenai pembelajaran digital dalam Pendidikan Agama Islam dengan menyajikan bukti kualitatif bahwa pembelajaran berbasis web dapat mendukung transformasi pedagogis sekaligus memperkuat keterlibatan siswa dan pembelajaran mandiri dalam konteks sekolah menengah pertama Islam.